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FMI-Wissenschaftler betreiben biomedizinische Grundlagenforschung und nutzen dabei neuste Technologien wie genetische Ansätze in Modellorganismen, detaillierte Proteom- und Genomanalysen, quantitative Bildgebung und Live-Fluoreszenzdarstellung und Strukturbestimmungen.
Das Friedrich Miescher Institute ist eine Marke mit Tradition und wurde bereits am 10. April 1970 auf Initiative von zwei unabhängigen Unternehmen, der Ciba Aktiengesellschaft und der J.R. Geigy AG, als Stiftung gegründet. Benannt ist das Institut nach dem Basler Wissenschaftler Friedrich Miescher (1844-1895), dem es als Erstem gelang, Nukleinsäuren in reiner Form zu gewinnen. Das Corporate Design ist dezent zurückhaltend ausgelegt und unterstreicht die wissenschaftliche Arbeit des Instituts.